沈保根院士长期从事磁性物理学和磁性材料的研究工作，他的主要研究方向为：功能材料的磁性和磁热效应；稀土永磁材料的结构。

      沈保根院士开展了非晶态合金的磁性和输运性质研究，解释了金属—金属基非晶态合金中磁性和电性的反常现象；研究了稀土—铁基化合物的结构与磁性，合成出多种新型纳米晶稀土永磁材料，揭示了它们的矫顽力机理；研究了稀土—过渡族化合物的晶体结构、相变、磁性和磁热效应，发现了多种新型大磁热效应材料，阐明了一级相变体系中磁热效应的物理机制。